Thân vương bị một loạt các cơn đột quỵ vào tháng 5 năm 1988 và đã phẫu thuật cho khối máu tụ dưới màng cứng cấp tính.[1] Cuối cùng ông đã bị liệt từ thắt lưng trở xuống, buộc ông phải sử dụng xe lăn để di chuyển.[2] Mặc dù vậy, ông vẫn tích cực trong trong các hoạt động của các thành viên Hoàng gia và xuất hiện thường xuyên tại các lễ trao giải, các sự kiện ngoại giao và là chủ tịch của các tổ chức từ thiện khác nhau. Tuy nhiên, ông đã phải nhập viện từ năm 2008 vì nhiễm trùng huyết.[1][2] Đầu năm 2014, Thân vương được chẩn đoán mắc một căn bệnh không xác định đã ảnh hưởng và khiến tim ông rơi vào tình trạng xấu. Vào đầu giờ sáng ngày 8 tháng 6 năm 2014, ông bị một cơn đau tim dữ dội và mặc dù đã cố gắng hết sức nhưng không may, ông đã qua đời vào lúc 10:50 sáng (giờ địa phương), hưởng thọ 66 tuổi.[3][4] Vào ngày 17 tháng 6 năm 2014, nghi thức tang lễ chính cho Thân vương, được gọi là "Renso no Gi", được tổ chức tại Nghĩa trang Hoàng gia Toshimagaoka ở Tokyo.[5] Khoảng 560 chức sắc bao gồm các thành viên của Hoàng gia đã tham dự lễ tang. Thân vương Takahito và Thân vương phi Yuriko, cha mẹ ông, đã thực hiện những nghi thức của người chịu tang chính và cháu gái của ông, Nữ vương Akiko, là người tổ chức buổi lễ.[6]

Sự kết thúc của nhánh Katsura-no-miya

Thân vương Yoshihito chưa bao giờ kết hôn và cũng không có con, các chị của ông là nữ quyến Hoàng thất. Ông qua đời mà không có con cháu kế thừa nên cái chết của ông đã đánh dấu sự kết thúc của nhánh Katsura-no-miya của Hoàng gia và cũng là nhánh do ông đứng đầu. Cuối cùng, số lượng các thành viên trong nhánh mẹ Mikasa-no-miya nói riêng và Hoàng gia nói chung đã giảm xuống. Vào thời điểm này, cha mẹ và các chị gái của ông vẫn còn sống.[7]